Protein–RNA interactions for Protein: Q12697

YPK9, Vacuolar cation-transporting ATPase YPK9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPK9Q12697 ISD11YER048W-A 285 nt0.16□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 RPS24BYIL069C 408 nt0.16□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 RPS7BYNL096C 573 nt0.16□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 IES4YOR189W 351 nt0.16□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 YOP1YPR028W 543 nt0.16□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 YPR172WYPR172W 603 nt0.16□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 REF2YDR195W 1602 nt0.16□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 snR34snR34 203 nt0.16□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 YBR184WYBR184W 1572 nt0.15□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 DBP6YNR038W 1890 nt0.15□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 CHS6YJL099W 2241 nt0.15□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 PSF2YJL072C 642 nt0.15□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 MRPL50YNR022C 420 nt0.15□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 YPR153WYPR153W 423 nt0.15□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 SUS1YBR111W-A 291 nt0.15□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 LSO2YGR169C-A 279 nt0.14□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 YPL080CYPL080C 327 nt0.14□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 ATP20YPR020W 348 nt0.14□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 HAL9YOL089C 3093 nt0.14□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.13□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 SLI15YBR156C 2097 nt0.13□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 RUB1YDR139C 234 nt0.13□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 RSM18YER050C 417 nt0.13□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 YGR042WYGR042W 816 nt0.13□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 IRC13YOR235W 315 nt0.13□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 YOR366WYOR366W 354 nt0.13□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 snR44snR44 211 nt0.13□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt0.12□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 SCW11YGL028C 1629 nt0.12□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 YDL152WYDL152W 366 nt0.12□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 VPS63YLR261C 327 nt0.12□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 ATC1YDR184C 885 nt0.11□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 TIM8YJR135W-A 264 nt0.11□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.1□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 YGL204CYGL204C 306 nt0.1□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 SDH2YLL041C 801 nt0.1□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.1□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 NOP9YJL010C 2001 nt0.1□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 KAR1YNL188W 1302 nt0.1□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 snR59snR59 78 nt0.1□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 MET32YDR253C 576 nt0.1□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.1□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.1□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 LOA1YPR139C 903 nt0.1□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 YPR170CYPR170C 336 nt0.1□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 SAG1YJR004C 1953 nt0.09□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 SPO23YBR250W 1572 nt0.09□□□□□ -2.39
YPK9Q12697 RMD6YEL072W 696 nt0.09□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.09□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 YJL007CYJL007C 315 nt0.09□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 YOR282WYOR282W 321 nt0.09□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 VPS52YDR484W 1926 nt0.08□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 IRC2YDR112W 309 nt0.08□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 SWI5YDR146C 2130 nt0.08□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 ARV1YLR242C 966 nt0.07□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 YDR114CYDR114C 303 nt0.06□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.06□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 SPO11YHL022C 1197 nt0.06□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 GPX1YKL026C 504 nt0.06□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 LCD1YDR499W 2244 nt0.06□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 MMS4YBR098W 2076 nt0.06□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 AIM44YPL158C 2277 nt0.05□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 PMP1YCR024C-A 123 nt0.05□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 HNT1YDL125C 477 nt0.05□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 YDR008CYDR008C 351 nt0.05□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 YHL042WYHL042W 453 nt0.05□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 COX3Q0275 810 nt0.05□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 DFG10YIL049W 762 nt0.05□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 RPL37AYLR185W 267 nt0.05□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 ATG16YMR159C 453 nt0.05□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 RRT1YBL048W 312 nt0.05□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.05□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 SRB7YDR308C 423 nt0.04□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 URB1YKL014C 5295 nt0.04□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 NPR2YEL062W 1848 nt0.04□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 DAD1YDR016C 285 nt0.03□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 YHR054CYHR054C 1065 nt0.03□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt0.03□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 ZIP1YDR285W 2628 nt0.03□□□□□ -2.4
YPK9Q12697 UPS1YLR193C 528 nt0.03□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 YOR053WYOR053W 342 nt0.03□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.02□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.02□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 RPS30AYLR287C-A 192 nt0.02□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 RPL26BYGR034W 384 nt0.01□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 TFB5YDR079C-A 219 nt0□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 SBH1YER087C-B 249 nt0□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt0□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 YPR099CYPR099C 357 nt0□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 snR84snR84 550 nt-0.01□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 YER158W-AYER158W-A 216 nt-0.01□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 ACF4YJR083C 930 nt-0.01□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.01□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 RCN2YOR220W 798 nt-0.01□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 AFR1YDR085C 1863 nt-0.01□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 snR79snR79 84 nt-0.02□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-0.02□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 GIM5YML094W 492 nt-0.02□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-0.02□□□□□ -2.41
YPK9Q12697 BIG1YHR101C 1008 nt-0.03□□□□□ -2.41
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