Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.43□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 RPL9BYNL067W 576 nt1.43□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 YOP1YPR028W 543 nt1.43□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 MVP1YMR004W 1536 nt1.43□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 MSH6YDR097C 3729 nt1.43□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 SPC110YDR356W 2835 nt1.43□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 KAP122YGL016W 3246 nt1.42□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 SWI5YDR146C 2130 nt1.42□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 ENV11YGR071C 2583 nt1.42□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 TRX1YLR043C 312 nt1.42□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 YAR047CYAR047C 321 nt1.42□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 YBL073WYBL073W 312 nt1.42□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 YBP1YBR216C 2025 nt1.41□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 SRP14YDL092W 441 nt1.41□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 RTR1YER139C 681 nt1.41□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 HHT1YBR010W 411 nt1.41□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 YPR012WYPR012W 255 nt1.41□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 LYS14YDR034C 2373 nt1.41□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 BRR2YER172C 6492 nt1.41□□□□□ -2.18
HMS1Q12398 YOR121CYOR121C 306 nt1.4□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 CTR9YOL145C 3234 nt1.4□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 SXM1YDR395W 2835 nt1.4□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 SEY1YOR165W 2331 nt1.4□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 PCF11YDR228C 1881 nt1.39□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 PMD1YER132C 5262 nt1.39□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 CYC7YEL039C 342 nt1.39□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.39□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 FMP23YBR047W 528 nt1.39□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 REV3YPL167C 4515 nt1.39□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 TRM3YDL112W 4311 nt1.39□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 AIM9YER080W 1884 nt1.39□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 HMI1YOL095C 2121 nt1.38□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 SPO24YPR036W-A 204 nt1.38□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 NUT2YPR168W 474 nt1.38□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 POL5YEL055C 3069 nt1.37□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.37□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 YJL022WYJL022W 309 nt1.37□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 CCH1YGR217W 6120 nt1.37□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 YJR098CYJR098C 1971 nt1.37□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 YHL041WYHL041W 450 nt1.36□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 YKL083WYKL083W 615 nt1.36□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 YLR334CYLR334C 381 nt1.36□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 YPL229WYPL229W 621 nt1.36□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 ALK1YGL021W 2283 nt1.36□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 HKR1YDR420W 5409 nt1.35□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 RFX1YLR176C 2436 nt1.35□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 HMRA1YCR097W 381 nt1.35□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 PAU3YCR104W 375 nt1.35□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 YHL037CYHL037C 402 nt1.35□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 SEC21YNL287W 2808 nt1.34□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 ADR1YDR216W 3972 nt1.34□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.34□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 UPS1YLR193C 528 nt1.34□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.34□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 PAC1YOR269W 1485 nt1.34□□□□□ -2.19
HMS1Q12398 RPL40BYKR094C 387 nt1.33□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 MAK10YEL053C 2202 nt1.33□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 IRA1YBR140C 9279 nt1.33□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 YLL032CYLL032C 2478 nt1.33□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 YCS4YLR272C 3531 nt1.33□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 PAU2YEL049W 363 nt1.32□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 YIL059CYIL059C 366 nt1.32□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 YIL102CYIL102C 306 nt1.32□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 PFD1YJL179W 330 nt1.32□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 VPS55YJR044C 423 nt1.32□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 MRPL31YKL138C 396 nt1.32□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 RPS27AYKL156W 249 nt1.32□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 IRE1YHR079C 3348 nt1.32□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 PBY1YBR094W 2262 nt1.32□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 SFB2YNL049C 2631 nt1.32□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 NUT1YGL151W 3399 nt1.31□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 MEC1YBR136W 7107 nt1.31□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 CSN9YDR179C 489 nt1.31□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.31□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 COF1YLL050C 432 nt1.31□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 YPL261CYPL261C 309 nt1.31□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 CTF4YPR135W 2784 nt1.3□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 PIG1YLR273C 1947 nt1.3□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 YJR003CYJR003C 1560 nt1.3□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 DGR2YKL121W 2559 nt1.3□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 MLH3YPL164C 2148 nt1.3□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 CDC36YDL165W 576 nt1.3□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 IRC23YOR044W 474 nt1.3□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.3□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 KIP1YBL063W 3336 nt1.3□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 CAT8YMR280C 4302 nt1.29□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 YGR035CYGR035C 351 nt1.29□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.29□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 EMC5YIL027C 426 nt1.29□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 YBR012CYBR012C 420 nt1.29□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 APL2YKL135C 2181 nt1.29□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 CDC31YOR257W 486 nt1.28□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 snR51snR51 107 nt1.28□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 SGO1YOR073W 1773 nt1.28□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 EFR3YMR212C 2349 nt1.28□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 ZIP1YDR285W 2628 nt1.28□□□□□ -2.2
HMS1Q12398 SWI6YLR182W 2412 nt1.27□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 snR56snR56 88 nt1.27□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 RPS20YHL015W 366 nt1.27□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 141.1 ms