Protein–RNA interactions for Protein: Q12069

PUS9, tRNA pseudouridine(32) synthase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS9Q12069 DUG2YBR281C 2637 nt2.55□□□□□ -2
PUS9Q12069 MPH1YIR002C 2982 nt2.55□□□□□ -2
PUS9Q12069 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
PUS9Q12069 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.55□□□□□ -2
PUS9Q12069 SBH1YER087C-B 249 nt2.55□□□□□ -2
PUS9Q12069 GRX8YLR364W 330 nt2.55□□□□□ -2
PUS9Q12069 TOP2YNL088W 4287 nt2.55□□□□□ -2
PUS9Q12069 SEC26YDR238C 2922 nt2.55□□□□□ -2
PUS9Q12069 YLR149CYLR149C 2193 nt2.54□□□□□ -2
PUS9Q12069 SSN2YDR443C 4263 nt2.54□□□□□ -2
PUS9Q12069 ESL2YKR096W 3588 nt2.54□□□□□ -2
PUS9Q12069 VPS34YLR240W 2628 nt2.54□□□□□ -2
PUS9Q12069 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.54□□□□□ -2
PUS9Q12069 VMA9YCL005W-A 222 nt2.54□□□□□ -2
PUS9Q12069 ESC1YMR219W 4977 nt2.53□□□□□ -2
PUS9Q12069 YGR067CYGR067C 2415 nt2.53□□□□□ -2
PUS9Q12069 YIL080WYIL080W 4722 nt2.53□□□□□ -2
PUS9Q12069 SMY2YBR172C 2223 nt2.53□□□□□ -2
PUS9Q12069 NPR3YHL023C 3441 nt2.53□□□□□ -2
PUS9Q12069 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt2.53□□□□□ -2
PUS9Q12069 HYP2YEL034W 474 nt2.53□□□□□ -2
PUS9Q12069 YIL174WYIL174W 228 nt2.53□□□□□ -2
PUS9Q12069 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.53□□□□□ -2
PUS9Q12069 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.53□□□□□ -2
PUS9Q12069 SGM1YJR134C 2124 nt2.53□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 RTT10YPL183C 3042 nt2.52□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 RPS22AYJL190C 393 nt2.52□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 EMC6YLL014W 327 nt2.52□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 YKU80YMR106C 1890 nt2.52□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 GRR1YJR090C 3456 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 NUP120YKL057C 3114 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 IKI3YLR384C 4050 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 ELG1YOR144C 2376 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 PXA2YKL188C 2562 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 RPB10YOR210W 213 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 FIR1YER032W 2631 nt2.51□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 RRP12YPL012W 3687 nt2.5□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 NAB3YPL190C 2409 nt2.5□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 AXL1YPR122W 3627 nt2.5□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 VPS35YJL154C 2835 nt2.5□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.5□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 GCV2YMR189W 3105 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 BUB1YGR188C 3066 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 YGR050CYGR050C 357 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 FKS3YMR306W 5358 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 PTP3YER075C 2787 nt2.49□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 SAK1YER129W 3429 nt2.48□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 PDR3YBL005W 2931 nt2.48□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 SEF1YBL066C 3447 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 snR70snR70 164 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 YPP1YGR198W 2454 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 TOR1YJR066W 7413 nt2.47□□□□□ -2.01
PUS9Q12069 POM152YMR129W 4014 nt2.46□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 YDL196WYDL196W 330 nt2.46□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.46□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 YBR174CYBR174C 315 nt2.46□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 SPO75YLL005C 2607 nt2.46□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 PSD2YGR170W 3417 nt2.46□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 FAR11YNL127W 2862 nt2.46□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 PAA1YDR071C 576 nt2.45□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt2.45□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt2.45□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 SPC98YNL126W 2541 nt2.45□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 PDR1YGL013C 3207 nt2.45□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 KRE33YNL132W 3171 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 RPS29AYLR388W 171 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 RGM1YMR182C 636 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 SLN1YIL147C 3663 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 UBP11YKR098C 2154 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 SGS1YMR190C 4344 nt2.44□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 NUM1YDR150W 8247 nt2.43□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 AHC1YOR023C 1701 nt2.42□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 NCA2YPR155C 1851 nt2.42□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 RPL42BYHR141C 321 nt2.42□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 RPL42AYNL162W 321 nt2.42□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 NEW1YPL226W 3591 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 NIP100YPL174C 2607 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 PEP3YLR148W 2757 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 ZRG17YNR039C 1818 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 YLR282CYLR282C 342 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 YBL012CYBL012C 402 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 CDC31YOR257W 486 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 snR43snR43 209 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 YBR277CYBR277C 402 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 TRA1YHR099W 11235 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 FIG4YNL325C 2640 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 MSC6YOR354C 2079 nt2.41□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 SWI6YLR182W 2412 nt2.4□□□□□ -2.02
PUS9Q12069 snR76snR76 109 nt2.4□□□□□ -2.03
PUS9Q12069 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt2.4□□□□□ -2.03
PUS9Q12069 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt2.4□□□□□ -2.03
PUS9Q12069 NOP10YHR072W-A 177 nt2.4□□□□□ -2.03
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