Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms