Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACSM1Q08AH1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms