Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

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Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.48□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 AFI1YOR129C 2682 nt2.48□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 SEF1YBL066C 3447 nt2.48□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 SMY2YBR172C 2223 nt2.48□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 PUT3YKL015W 2940 nt2.47□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 Q0143Q0143 153 nt2.47□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 VPS55YJR044C 423 nt2.47□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 TRX1YLR043C 312 nt2.47□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 CRM1YGR218W 3255 nt2.47□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 AMS1YGL156W 3252 nt2.46□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 HOS4YIL112W 3252 nt2.46□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 OLI1Q0130 231 nt2.46□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.46□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 YLR140WYLR140W 327 nt2.46□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 PEP3YLR148W 2757 nt2.46□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 CFT2YLR115W 2580 nt2.46□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 YKU80YMR106C 1890 nt2.45□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 TOP2YNL088W 4287 nt2.45□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 YBR184WYBR184W 1572 nt2.45□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 YJL135WYJL135W 318 nt2.45□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 VPS34YLR240W 2628 nt2.45□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 RRP6YOR001W 2202 nt2.45□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 EFR3YMR212C 2349 nt2.45□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 PDE2YOR360C 1581 nt2.44□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 SPF1YEL031W 3648 nt2.44□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 PHO2YDL106C 1680 nt2.44□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 NUP170YBL079W 4509 nt2.43□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 VPH1YOR270C 2523 nt2.43□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 SMY1YKL079W 1971 nt2.43□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 MGM1YOR211C 2646 nt2.43□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 SCH9YHR205W 2475 nt2.43□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 PDR11YIL013C 4236 nt2.43□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 GIS1YDR096W 2685 nt2.43□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 YKU70YMR284W 1809 nt2.42□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 PLC1YPL268W 2610 nt2.42□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 PHO91YNR013C 2685 nt2.42□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 GRR1YJR090C 3456 nt2.42□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 PXA2YKL188C 2562 nt2.42□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 SMC6YLR383W 3345 nt2.42□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 ORC2YBR060C 1863 nt2.41□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 MSB1YOR188W 3414 nt2.41□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 RRT15YLR162W-A 189 nt2.41□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 YNL114CYNL114C 372 nt2.41□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 SPT21YMR179W 2277 nt2.41□□□□□ -2.02
SGO1Q08490 YDR286CYDR286C 345 nt2.4□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 VPS8YAL002W 3825 nt2.4□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.4□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 YPR092WYPR092W 306 nt2.4□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 COS111YBR203W 2775 nt2.4□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 TOR1YJR066W 7413 nt2.4□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 YNL018CYNL018C 1839 nt2.4□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 VPS54YDR027C 2670 nt2.39□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 snR74snR74 88 nt2.39□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 SDH6YDR379C-A 240 nt2.39□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 YGL217CYGL217C 342 nt2.39□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 YBL083CYBL083C 426 nt2.39□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 MET18YIL128W 3099 nt2.39□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 SVL3YPL032C 2478 nt2.39□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 ZRG8YER033C 3231 nt2.38□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 INP2YMR163C 2118 nt2.38□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 SEC5YDR166C 2916 nt2.38□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 VMR1YHL035C 4779 nt2.37□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 YOL098CYOL098C 3114 nt2.37□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 ANS1YHR126C 480 nt2.37□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 RPL42BYHR141C 321 nt2.37□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.37□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 RPL42AYNL162W 321 nt2.37□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 YOR055WYOR055W 435 nt2.37□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.37□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 SNF5YBR289W 2718 nt2.37□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 SET2YJL168C 2202 nt2.37□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 YEF3YLR249W 3135 nt2.37□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 FAR11YNL127W 2862 nt2.36□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 RPH1YER169W 2391 nt2.36□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 MPT5YGL178W 2580 nt2.36□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 MNL2YLR057W 2550 nt2.36□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 MRP10YDL045W-A 288 nt2.36□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 RPS29AYLR388W 171 nt2.36□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 YOR376WYOR376W 369 nt2.36□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.35□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 KRE33YNL132W 3171 nt2.35□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 MUK1YPL070W 1839 nt2.35□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 TOF1YNL273W 3717 nt2.34□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 KIP1YBL063W 3336 nt2.34□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 VPS13YLL040C 9435 nt2.34□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 snR72snR72 98 nt2.34□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 YNL205CYNL205C 423 nt2.34□□□□□ -2.03
SGO1Q08490 PSD2YGR170W 3417 nt2.34□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 NUP100YKL068W 2880 nt2.34□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 YCR043CYCR043C 384 nt2.33□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 BRP1YGL007W 378 nt2.33□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.33□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.33□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.33□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 SLM1YIL105C 2061 nt2.32□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.32□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 RPB10YOR210W 213 nt2.32□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 SCD5YOR329C 2619 nt2.31□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 SWA2YDR320C 2007 nt2.31□□□□□ -2.04
SGO1Q08490 SWI6YLR182W 2412 nt2.31□□□□□ -2.04
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