Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DHX9Q08211 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DHX9Q08211 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms