Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 SEC3YER008C 4011 nt0.9□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 EAF1YDR359C 2949 nt0.89□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 YJR141WYJR141W 1044 nt0.89□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 ERP4YOR016C 624 nt0.89□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 YOR029WYOR029W 336 nt0.89□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 PAU24YBR301W 363 nt0.89□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 YDR509WYDR509W 348 nt0.88□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 YLL020CYLL020C 306 nt0.88□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 NOC3YLR002C 1992 nt0.88□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 SNU56YDR240C 1479 nt0.87□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 PAC1YOR269W 1485 nt0.87□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 MKT1YNL085W 2493 nt0.87□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 YDL016CYDL016C 303 nt0.87□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 YDR029WYDR029W 315 nt0.87□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 PAM16YJL104W 450 nt0.87□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 TMA22YJR014W 597 nt0.87□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.87□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 snR84snR84 550 nt0.86□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 SPT21YMR179W 2277 nt0.86□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 SWI6YLR182W 2412 nt0.86□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 YDR114CYDR114C 303 nt0.85□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.85□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 TSC3YBR058C-A 243 nt0.85□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 AIM44YPL158C 2277 nt0.85□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 SWI4YER111C 3282 nt0.84□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 SMC1YFL008W 3678 nt0.84□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 PIG1YLR273C 1947 nt0.84□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 YDR008CYDR008C 351 nt0.84□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.84□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 RPS30BYOR182C 192 nt0.84□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 snR14snR14 160 nt0.84□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 SPO23YBR250W 1572 nt0.83□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 IFH1YLR223C 3258 nt0.83□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 MPT5YGL178W 2580 nt0.83□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 MXR1YER042W 555 nt0.83□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 RTR1YER139C 681 nt0.83□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 YAP3YHL009C 993 nt0.83□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 snR13snR13 124 nt0.83□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.83□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 LYS14YDR034C 2373 nt0.83□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 NUT1YGL151W 3399 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 YGR025WYGR025W 303 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 SDH2YLL041C 801 nt0.82□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 RPL9AYGL147C 576 nt0.81□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.81□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 APQ13YJL075C 417 nt0.81□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 NUT2YPR168W 474 nt0.81□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 NUP145YGL092W 3954 nt0.81□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 KAP120YPL125W 3099 nt0.8□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 SAS3YBL052C 2496 nt0.8□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.8□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.8□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 HUR1YGL168W 333 nt0.8□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 BIG1YHR101C 1008 nt0.8□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 GPI15YNL038W 690 nt0.8□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 STB6YKL072W 2301 nt0.8□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 SCW11YGL028C 1629 nt0.79□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.79□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 RCN2YOR220W 798 nt0.79□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 PXA2YKL188C 2562 nt0.79□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 APL3YBL037W 3078 nt0.78□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 CDC39YCR093W 6327 nt0.78□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 YGL239CYGL239C 315 nt0.78□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 INA22YIR024C 651 nt0.78□□□□□ -2.28
TRM12Q04235 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.77□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.77□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 HIT1YJR055W 495 nt0.77□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 EAF6YJR082C 342 nt0.77□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 YBR012CYBR012C 420 nt0.77□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 OST1YJL002C 1431 nt0.77□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 SLY1YDR189W 2001 nt0.77□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 YLL032CYLL032C 2478 nt0.77□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 NUP157YER105C 4176 nt0.77□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 FIG4YNL325C 2640 nt0.76□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 RFX1YLR176C 2436 nt0.76□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 NHP2YDL208W 471 nt0.76□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 YIL059CYIL059C 366 nt0.76□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 RPL16AYIL133C 600 nt0.76□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 MRPL31YKL138C 396 nt0.76□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 RPS27AYKL156W 249 nt0.76□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 RUF22RUF22 515 nt0.76□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.76□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 EMC4YGL231C 573 nt0.75□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 YGR045CYGR045C 363 nt0.75□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 URM1YIL008W 300 nt0.75□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 UPS1YLR193C 528 nt0.75□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 PBI2YNL015W 228 nt0.75□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 RPL32YBL092W 393 nt0.75□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.75□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 RIM20YOR275C 1986 nt0.75□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 YCR001WYCR001W 315 nt0.74□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 YDR269CYDR269C 324 nt0.74□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 YER135CYER135C 393 nt0.74□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 IRC23YOR044W 474 nt0.74□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 YPL182CYPL182C 384 nt0.74□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 SET3YKR029C 2256 nt0.73□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 SEC1YDR164C 2175 nt0.73□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 YDR521WYDR521W 336 nt0.73□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.73□□□□□ -2.29
TRM12Q04235 RPF1YHR088W 888 nt0.73□□□□□ -2.29
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