Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLOD1Q02809 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms