Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.3 ms