Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX3Q00994 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms