Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNB1P98172 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms