Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNA1P78396 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms