Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA6P60900 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms