Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms