Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAX9P55771 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAX9P55771 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAX9P55771 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAX9P55771 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms