Protein–RNA interactions for Protein: P53940

APJ1, J domain-containing protein APJ1, yeastyeast

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APJ1P53940 YGL052WYGL052W 306 nt1.66□□□□□ -2.14
APJ1P53940 GPG1YGL121C 381 nt1.66□□□□□ -2.14
APJ1P53940 YGL239CYGL239C 315 nt1.66□□□□□ -2.14
APJ1P53940 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt1.66□□□□□ -2.14
APJ1P53940 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.66□□□□□ -2.14
APJ1P53940 YMR324CYMR324C 243 nt1.66□□□□□ -2.14
APJ1P53940 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.66□□□□□ -2.14
APJ1P53940 RIM20YOR275C 1986 nt1.66□□□□□ -2.14
APJ1P53940 MYO4YAL029C 4416 nt1.65□□□□□ -2.14
APJ1P53940 PRP39YML046W 1890 nt1.65□□□□□ -2.14
APJ1P53940 RRP6YOR001W 2202 nt1.65□□□□□ -2.15
APJ1P53940 PAU2YEL049W 363 nt1.65□□□□□ -2.15
APJ1P53940 YJL135WYJL135W 318 nt1.65□□□□□ -2.15
APJ1P53940 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.65□□□□□ -2.15
APJ1P53940 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.65□□□□□ -2.15
APJ1P53940 SAR1YPL218W 573 nt1.65□□□□□ -2.15
APJ1P53940 TRM7YBR061C 933 nt1.65□□□□□ -2.15
APJ1P53940 SIR4YDR227W 4077 nt1.65□□□□□ -2.15
APJ1P53940 ECM25YJL201W 1800 nt1.65□□□□□ -2.15
APJ1P53940 RTP1YMR185W 2946 nt1.65□□□□□ -2.15
APJ1P53940 RGA2YDR379W 3030 nt1.64□□□□□ -2.15
APJ1P53940 ATG11YPR049C 3537 nt1.64□□□□□ -2.15
APJ1P53940 snR60snR60 104 nt1.64□□□□□ -2.15
APJ1P53940 PHS1YJL097W 654 nt1.64□□□□□ -2.15
APJ1P53940 VIK1YPL253C 1944 nt1.64□□□□□ -2.15
APJ1P53940 BFA1YJR053W 1725 nt1.63□□□□□ -2.15
APJ1P53940 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.63□□□□□ -2.15
APJ1P53940 QCR7YDR529C 384 nt1.63□□□□□ -2.15
APJ1P53940 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.63□□□□□ -2.15
APJ1P53940 LSO2YGR169C-A 279 nt1.63□□□□□ -2.15
APJ1P53940 YHL041WYHL041W 450 nt1.63□□□□□ -2.15
APJ1P53940 YLR053CYLR053C 327 nt1.63□□□□□ -2.15
APJ1P53940 YLR140WYLR140W 327 nt1.63□□□□□ -2.15
APJ1P53940 YLR255CYLR255C 354 nt1.63□□□□□ -2.15
APJ1P53940 CYB5YNL111C 363 nt1.63□□□□□ -2.15
APJ1P53940 HHT1YBR010W 411 nt1.63□□□□□ -2.15
APJ1P53940 FAB1YFR019W 6837 nt1.63□□□□□ -2.15
APJ1P53940 GYP5YPL249C 2685 nt1.62□□□□□ -2.15
APJ1P53940 UTP21YLR409C 2820 nt1.62□□□□□ -2.15
APJ1P53940 YEL014CYEL014C 306 nt1.62□□□□□ -2.15
APJ1P53940 LCL2YLR104W 396 nt1.62□□□□□ -2.15
APJ1P53940 YNL010WYNL010W 726 nt1.62□□□□□ -2.15
APJ1P53940 YOR015WYOR015W 360 nt1.62□□□□□ -2.15
APJ1P53940 YPR063CYPR063C 423 nt1.62□□□□□ -2.15
APJ1P53940 CDC60YPL160W 3273 nt1.62□□□□□ -2.15
APJ1P53940 LRE1YCL051W 1752 nt1.62□□□□□ -2.15
APJ1P53940 MDM20YOL076W 2391 nt1.62□□□□□ -2.15
APJ1P53940 ATG9YDL149W 2994 nt1.62□□□□□ -2.15
APJ1P53940 PDR8YLR266C 2106 nt1.61□□□□□ -2.15
APJ1P53940 VPH1YOR270C 2523 nt1.61□□□□□ -2.15
APJ1P53940 snR48snR48 113 nt1.61□□□□□ -2.15
APJ1P53940 PSO2YMR137C 1986 nt1.61□□□□□ -2.15
APJ1P53940 IPT1YDR072C 1584 nt1.6□□□□□ -2.15
APJ1P53940 RAM2YKL019W 951 nt1.6□□□□□ -2.15
APJ1P53940 UPS1YLR193C 528 nt1.6□□□□□ -2.15
APJ1P53940 TMA7YLR262C-A 195 nt1.6□□□□□ -2.15
APJ1P53940 YMR321CYMR321C 318 nt1.6□□□□□ -2.15
APJ1P53940 DNF3YMR162C 4971 nt1.6□□□□□ -2.15
APJ1P53940 ASG1YIL130W 2895 nt1.6□□□□□ -2.15
APJ1P53940 HDA3YPR179C 1968 nt1.59□□□□□ -2.15
APJ1P53940 DFG16YOR030W 1860 nt1.59□□□□□ -2.15
APJ1P53940 YGR250CYGR250C 2346 nt1.59□□□□□ -2.15
APJ1P53940 RBK1YCR036W 1002 nt1.59□□□□□ -2.15
APJ1P53940 NPC2YDL046W 522 nt1.59□□□□□ -2.15
APJ1P53940 YHR210CYHR210C 1026 nt1.59□□□□□ -2.15
APJ1P53940 VPS8YAL002W 3825 nt1.59□□□□□ -2.15
APJ1P53940 VPS55YJR044C 423 nt1.59□□□□□ -2.15
APJ1P53940 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.59□□□□□ -2.15
APJ1P53940 VPS34YLR240W 2628 nt1.59□□□□□ -2.16
APJ1P53940 CHC1YGL206C 4962 nt1.59□□□□□ -2.16
APJ1P53940 NCL1YBL024W 2055 nt1.59□□□□□ -2.16
APJ1P53940 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.58□□□□□ -2.16
APJ1P53940 KAR3YPR141C 2190 nt1.58□□□□□ -2.16
APJ1P53940 OLI1Q0130 231 nt1.58□□□□□ -2.16
APJ1P53940 RPS27AYKL156W 249 nt1.58□□□□□ -2.16
APJ1P53940 PCC1YKR095W-A 267 nt1.58□□□□□ -2.16
APJ1P53940 YNL028WYNL028W 318 nt1.58□□□□□ -2.16
APJ1P53940 YBL083CYBL083C 426 nt1.58□□□□□ -2.16
APJ1P53940 BUD2YKL092C 3315 nt1.58□□□□□ -2.16
APJ1P53940 RTT101YJL047C 2529 nt1.58□□□□□ -2.16
APJ1P53940 MGA2YIR033W 3342 nt1.57□□□□□ -2.16
APJ1P53940 VPS15YBR097W 4365 nt1.57□□□□□ -2.16
APJ1P53940 YGL024WYGL024W 336 nt1.57□□□□□ -2.16
APJ1P53940 YGL069CYGL069C 465 nt1.57□□□□□ -2.16
APJ1P53940 YGR164WYGR164W 336 nt1.57□□□□□ -2.16
APJ1P53940 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.57□□□□□ -2.16
APJ1P53940 YIL059CYIL059C 366 nt1.57□□□□□ -2.16
APJ1P53940 RPL38YLR325C 237 nt1.57□□□□□ -2.16
APJ1P53940 CSE2YNR010W 450 nt1.57□□□□□ -2.16
APJ1P53940 TRL1YJL087C 2484 nt1.56□□□□□ -2.16
APJ1P53940 RTC6YPL183W-A 282 nt1.56□□□□□ -2.16
APJ1P53940 LHS1YKL073W 2646 nt1.55□□□□□ -2.16
APJ1P53940 NUP120YKL057C 3114 nt1.55□□□□□ -2.16
APJ1P53940 SMD1YGR074W 441 nt1.55□□□□□ -2.16
APJ1P53940 YBR224WYBR224W 516 nt1.55□□□□□ -2.16
APJ1P53940 UBP11YKR098C 2154 nt1.55□□□□□ -2.16
APJ1P53940 YNL144CYNL144C 2223 nt1.54□□□□□ -2.16
APJ1P53940 YOR093CYOR093C 4947 nt1.54□□□□□ -2.16
APJ1P53940 SSS1YDR086C 243 nt1.54□□□□□ -2.16
APJ1P53940 YDR426CYDR426C 378 nt1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.7 ms