Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RORCP51449 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RORCP51449 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RORCP51449 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RORCP51449 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RORCP51449 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RORCP51449 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RORCP51449 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RORCP51449 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RORCP51449 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RORCP51449 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RORCP51449 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RORCP51449 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RORCP51449 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RORCP51449 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RORCP51449 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RORCP51449 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RORCP51449 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RORCP51449 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RORCP51449 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RORCP51449 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RORCP51449 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RORCP51449 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RORCP51449 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RORCP51449 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RORCP51449 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RORCP51449 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RORCP51449 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RORCP51449 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RORCP51449 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RORCP51449 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RORCP51449 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RORCP51449 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RORCP51449 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RORCP51449 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RORCP51449 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RORCP51449 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RORCP51449 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RORCP51449 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RORCP51449 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RORCP51449 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RORCP51449 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RORCP51449 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RORCP51449 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RORCP51449 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RORCP51449 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RORCP51449 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RORCP51449 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RORCP51449 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RORCP51449 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RORCP51449 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RORCP51449 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RORCP51449 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RORCP51449 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RORCP51449 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RORCP51449 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms