Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NESP48681 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
NESP48681 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
NESP48681 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NESP48681 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NESP48681 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
NESP48681 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NESP48681 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NESP48681 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
NESP48681 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NESP48681 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NESP48681 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NESP48681 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NESP48681 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
NESP48681 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
NESP48681 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NESP48681 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NESP48681 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NESP48681 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NESP48681 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NESP48681 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NESP48681 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NESP48681 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NESP48681 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
NESP48681 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NESP48681 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NESP48681 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NESP48681 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NESP48681 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
NESP48681 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NESP48681 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NESP48681 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NESP48681 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NESP48681 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NESP48681 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NESP48681 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NESP48681 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NESP48681 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NESP48681 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NESP48681 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NESP48681 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NESP48681 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NESP48681 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NESP48681 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
NESP48681 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NESP48681 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NESP48681 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NESP48681 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NESP48681 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NESP48681 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NESP48681 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NESP48681 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
NESP48681 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NESP48681 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
NESP48681 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NESP48681 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NESP48681 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NESP48681 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NESP48681 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NESP48681 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NESP48681 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NESP48681 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NESP48681 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NESP48681 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NESP48681 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
NESP48681 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
NESP48681 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NESP48681 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NESP48681 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NESP48681 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NESP48681 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NESP48681 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NESP48681 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NESP48681 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
NESP48681 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NESP48681 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
NESP48681 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
NESP48681 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
NESP48681 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NESP48681 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NESP48681 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
NESP48681 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NESP48681 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NESP48681 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NESP48681 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NESP48681 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NESP48681 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NESP48681 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NESP48681 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NESP48681 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NESP48681 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NESP48681 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NESP48681 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NESP48681 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NESP48681 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
NESP48681 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NESP48681 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
NESP48681 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NESP48681 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NESP48681 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms