Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UTRNP46939 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UTRNP46939 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UTRNP46939 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UTRNP46939 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UTRNP46939 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UTRNP46939 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UTRNP46939 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UTRNP46939 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UTRNP46939 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UTRNP46939 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UTRNP46939 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UTRNP46939 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UTRNP46939 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UTRNP46939 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UTRNP46939 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UTRNP46939 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UTRNP46939 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UTRNP46939 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UTRNP46939 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
UTRNP46939 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UTRNP46939 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UTRNP46939 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UTRNP46939 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UTRNP46939 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UTRNP46939 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UTRNP46939 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UTRNP46939 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UTRNP46939 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UTRNP46939 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UTRNP46939 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UTRNP46939 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UTRNP46939 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UTRNP46939 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UTRNP46939 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UTRNP46939 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UTRNP46939 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UTRNP46939 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UTRNP46939 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UTRNP46939 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UTRNP46939 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UTRNP46939 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UTRNP46939 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UTRNP46939 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UTRNP46939 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UTRNP46939 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UTRNP46939 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UTRNP46939 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UTRNP46939 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UTRNP46939 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UTRNP46939 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UTRNP46939 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UTRNP46939 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UTRNP46939 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UTRNP46939 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UTRNP46939 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UTRNP46939 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UTRNP46939 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UTRNP46939 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UTRNP46939 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UTRNP46939 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UTRNP46939 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UTRNP46939 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UTRNP46939 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UTRNP46939 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UTRNP46939 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UTRNP46939 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UTRNP46939 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UTRNP46939 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UTRNP46939 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms