Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPL28P46779 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RPL28P46779 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms