Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms