Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR4A2P43354 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms