Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPHP41219 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPHP41219 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPHP41219 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPHP41219 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPHP41219 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPHP41219 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPHP41219 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPHP41219 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPHP41219 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPHP41219 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPHP41219 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPHP41219 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPHP41219 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPHP41219 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPHP41219 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPHP41219 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPHP41219 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPHP41219 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPHP41219 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPHP41219 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPHP41219 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPHP41219 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPHP41219 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPHP41219 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPHP41219 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRPHP41219 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRPHP41219 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPHP41219 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPHP41219 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPHP41219 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPHP41219 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPHP41219 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPHP41219 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPHP41219 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPHP41219 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPHP41219 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPHP41219 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPHP41219 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms