Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTNNB1P35222 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms