Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCC1P33527 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC1P33527 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms