Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG3P32926 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG3P32926 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG3P32926 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG3P32926 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG3P32926 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG3P32926 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG3P32926 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG3P32926 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG3P32926 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG3P32926 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG3P32926 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG3P32926 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG3P32926 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG3P32926 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG3P32926 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG3P32926 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG3P32926 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG3P32926 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG3P32926 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG3P32926 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG3P32926 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG3P32926 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG3P32926 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG3P32926 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG3P32926 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG3P32926 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG3P32926 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG3P32926 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG3P32926 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG3P32926 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG3P32926 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG3P32926 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG3P32926 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG3P32926 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG3P32926 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG3P32926 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.1 ms