Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA11P31270 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA11P31270 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms