Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM4SF1P30408 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms