Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LTKP29376 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTKP29376 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTKP29376 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTKP29376 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTKP29376 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTKP29376 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTKP29376 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LTKP29376 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LTKP29376 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LTKP29376 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LTKP29376 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LTKP29376 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LTKP29376 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LTKP29376 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LTKP29376 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LTKP29376 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LTKP29376 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LTKP29376 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LTKP29376 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LTKP29376 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LTKP29376 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTKP29376 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTKP29376 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTKP29376 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTKP29376 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LTKP29376 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTKP29376 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTKP29376 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTKP29376 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTKP29376 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTKP29376 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTKP29376 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTKP29376 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTKP29376 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTKP29376 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LTKP29376 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTKP29376 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTKP29376 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTKP29376 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTKP29376 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTKP29376 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTKP29376 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTKP29376 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTKP29376 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTKP29376 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTKP29376 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTKP29376 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LTKP29376 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LTKP29376 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LTKP29376 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTKP29376 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTKP29376 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTKP29376 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTKP29376 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTKP29376 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTKP29376 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTKP29376 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTKP29376 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTKP29376 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTKP29376 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LTKP29376 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTKP29376 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTKP29376 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LTKP29376 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTKP29376 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTKP29376 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTKP29376 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTKP29376 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LTKP29376 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTKP29376 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTKP29376 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LTKP29376 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTKP29376 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTKP29376 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTKP29376 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTKP29376 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LTKP29376 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTKP29376 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LTKP29376 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTKP29376 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTKP29376 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTKP29376 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTKP29376 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTKP29376 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTKP29376 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTKP29376 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTKP29376 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTKP29376 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTKP29376 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTKP29376 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LTKP29376 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LTKP29376 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LTKP29376 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LTKP29376 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LTKP29376 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LTKP29376 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LTKP29376 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LTKP29376 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LTKP29376 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms