Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDM5AP29375 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms