Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTFP26441 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTFP26441 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTFP26441 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTFP26441 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTFP26441 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTFP26441 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTFP26441 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTFP26441 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTFP26441 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTFP26441 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTFP26441 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFP26441 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFP26441 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFP26441 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFP26441 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFP26441 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFP26441 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFP26441 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFP26441 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFP26441 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFP26441 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFP26441 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFP26441 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFP26441 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFP26441 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFP26441 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNTFP26441 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTFP26441 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTFP26441 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTFP26441 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTFP26441 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTFP26441 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTFP26441 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTFP26441 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTFP26441 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNTFP26441 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms