Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFKBIAP25963 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFKBIAP25963 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms