Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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