Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FGFR4P22455 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms