Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2CP19387 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms