Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPN2P17655 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN2P17655 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms