Protein–RNA interactions for Protein: P17213

BPI, Bactericidal permeability-increasing protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIP17213 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIP17213 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIP17213 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIP17213 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIP17213 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIP17213 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIP17213 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIP17213 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIP17213 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIP17213 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIP17213 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIP17213 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BPIP17213 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BPIP17213 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BPIP17213 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BPIP17213 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms