Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB4P16144 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms