Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHGAP10645 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHGAP10645 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHGAP10645 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHGAP10645 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHGAP10645 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CHGAP10645 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHGAP10645 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHGAP10645 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHGAP10645 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHGAP10645 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHGAP10645 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHGAP10645 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHGAP10645 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHGAP10645 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHGAP10645 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHGAP10645 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHGAP10645 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHGAP10645 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CHGAP10645 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CHGAP10645 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
CHGAP10645 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CHGAP10645 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CHGAP10645 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHGAP10645 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHGAP10645 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHGAP10645 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CHGAP10645 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHGAP10645 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHGAP10645 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHGAP10645 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHGAP10645 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHGAP10645 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHGAP10645 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHGAP10645 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHGAP10645 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHGAP10645 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHGAP10645 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHGAP10645 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHGAP10645 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHGAP10645 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHGAP10645 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHGAP10645 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CHGAP10645 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHGAP10645 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHGAP10645 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHGAP10645 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHGAP10645 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHGAP10645 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHGAP10645 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHGAP10645 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHGAP10645 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CHGAP10645 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHGAP10645 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHGAP10645 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHGAP10645 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHGAP10645 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHGAP10645 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHGAP10645 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHGAP10645 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHGAP10645 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CHGAP10645 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHGAP10645 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms