Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI3P10071 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI3P10071 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI3P10071 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI3P10071 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI3P10071 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI3P10071 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI3P10071 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI3P10071 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI3P10071 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI3P10071 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI3P10071 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI3P10071 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI3P10071 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI3P10071 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI3P10071 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI3P10071 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI3P10071 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI3P10071 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI3P10071 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI3P10071 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI3P10071 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI3P10071 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI3P10071 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI3P10071 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GLI3P10071 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GLI3P10071 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GLI3P10071 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GLI3P10071 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI3P10071 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI3P10071 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI3P10071 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI3P10071 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI3P10071 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI3P10071 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI3P10071 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI3P10071 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI3P10071 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GLI3P10071 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI3P10071 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI3P10071 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI3P10071 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI3P10071 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI3P10071 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI3P10071 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI3P10071 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI3P10071 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GLI3P10071 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI3P10071 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI3P10071 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI3P10071 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI3P10071 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI3P10071 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI3P10071 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI3P10071 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI3P10071 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI3P10071 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI3P10071 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI3P10071 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI3P10071 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GLI3P10071 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms