Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD1P0DJD0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms