Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC172P0C7W6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms