Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIL1P09327 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VIL1P09327 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIL1P09327 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIL1P09327 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIL1P09327 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VIL1P09327 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIL1P09327 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIL1P09327 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIL1P09327 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VIL1P09327 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIL1P09327 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIL1P09327 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VIL1P09327 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VIL1P09327 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIL1P09327 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIL1P09327 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIL1P09327 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIL1P09327 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIL1P09327 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VIL1P09327 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIL1P09327 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIL1P09327 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIL1P09327 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIL1P09327 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIL1P09327 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIL1P09327 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIL1P09327 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIL1P09327 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VIL1P09327 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VIL1P09327 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIL1P09327 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIL1P09327 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIL1P09327 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIL1P09327 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIL1P09327 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIL1P09327 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIL1P09327 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VIL1P09327 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIL1P09327 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIL1P09327 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIL1P09327 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIL1P09327 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIL1P09327 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIL1P09327 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIL1P09327 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIL1P09327 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIL1P09327 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIL1P09327 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIL1P09327 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIL1P09327 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VIL1P09327 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIL1P09327 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIL1P09327 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIL1P09327 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIL1P09327 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VIL1P09327 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIL1P09327 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIL1P09327 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VIL1P09327 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIL1P09327 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIL1P09327 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms