Protein–RNA interactions for Protein: P08425

MSF1, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSF1P08425 BER1YLR412W 825 nt1.01□□□□□ -2.25
MSF1P08425 YPR039WYPR039W 336 nt1.01□□□□□ -2.25
MSF1P08425 PIG1YLR273C 1947 nt1□□□□□ -2.25
MSF1P08425 YKL044WYKL044W 321 nt1□□□□□ -2.25
MSF1P08425 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt1□□□□□ -2.25
MSF1P08425 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1□□□□□ -2.25
MSF1P08425 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1□□□□□ -2.25
MSF1P08425 IRC16YPR038W 360 nt1□□□□□ -2.25
MSF1P08425 MKT1YNL085W 2493 nt1□□□□□ -2.25
MSF1P08425 NUP145YGL092W 3954 nt0.99□□□□□ -2.25
MSF1P08425 SWI6YLR182W 2412 nt0.99□□□□□ -2.25
MSF1P08425 MPT5YGL178W 2580 nt0.99□□□□□ -2.25
MSF1P08425 YDR008CYDR008C 351 nt0.99□□□□□ -2.25
MSF1P08425 EAF1YDR359C 2949 nt0.98□□□□□ -2.25
MSF1P08425 snR84snR84 550 nt0.98□□□□□ -2.25
MSF1P08425 YDR114CYDR114C 303 nt0.98□□□□□ -2.25
MSF1P08425 YFL012WYFL012W 447 nt0.98□□□□□ -2.25
MSF1P08425 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.98□□□□□ -2.25
MSF1P08425 SVS1YPL163C 783 nt0.98□□□□□ -2.25
MSF1P08425 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.97□□□□□ -2.25
MSF1P08425 LYS14YDR034C 2373 nt0.97□□□□□ -2.25
MSF1P08425 KAP120YPL125W 3099 nt0.96□□□□□ -2.26
MSF1P08425 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.96□□□□□ -2.26
MSF1P08425 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.96□□□□□ -2.26
MSF1P08425 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.96□□□□□ -2.26
MSF1P08425 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
MSF1P08425 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
MSF1P08425 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
MSF1P08425 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
MSF1P08425 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
MSF1P08425 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
MSF1P08425 YJR141WYJR141W 1044 nt0.96□□□□□ -2.26
MSF1P08425 NUT2YPR168W 474 nt0.96□□□□□ -2.26
MSF1P08425 STB6YKL072W 2301 nt0.96□□□□□ -2.26
MSF1P08425 NUT1YGL151W 3399 nt0.96□□□□□ -2.26
MSF1P08425 APL3YBL037W 3078 nt0.96□□□□□ -2.26
MSF1P08425 YJR003CYJR003C 1560 nt0.96□□□□□ -2.26
MSF1P08425 SPO23YBR250W 1572 nt0.96□□□□□ -2.26
MSF1P08425 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.95□□□□□ -2.26
MSF1P08425 HIT1YJR055W 495 nt0.94□□□□□ -2.26
MSF1P08425 SDH2YLL041C 801 nt0.94□□□□□ -2.26
MSF1P08425 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.94□□□□□ -2.26
MSF1P08425 YBR012CYBR012C 420 nt0.94□□□□□ -2.26
MSF1P08425 IFH1YLR223C 3258 nt0.94□□□□□ -2.26
MSF1P08425 SAS3YBL052C 2496 nt0.94□□□□□ -2.26
MSF1P08425 SCW11YGL028C 1629 nt0.93□□□□□ -2.26
MSF1P08425 OCA6YDR067C 675 nt0.93□□□□□ -2.26
MSF1P08425 MET32YDR253C 576 nt0.93□□□□□ -2.26
MSF1P08425 APQ13YJL075C 417 nt0.93□□□□□ -2.26
MSF1P08425 ERP4YOR016C 624 nt0.93□□□□□ -2.26
MSF1P08425 YJR029WYJR029W 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
MSF1P08425 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
MSF1P08425 PXA2YKL188C 2562 nt0.93□□□□□ -2.26
MSF1P08425 YGR045CYGR045C 363 nt0.92□□□□□ -2.26
MSF1P08425 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.92□□□□□ -2.26
MSF1P08425 YDL016CYDL016C 303 nt0.91□□□□□ -2.26
MSF1P08425 UBX4YMR067C 1251 nt0.91□□□□□ -2.26
MSF1P08425 IRC23YOR044W 474 nt0.91□□□□□ -2.26
MSF1P08425 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.91□□□□□ -2.26
MSF1P08425 CDC39YCR093W 6327 nt0.91□□□□□ -2.26
MSF1P08425 FIG4YNL325C 2640 nt0.9□□□□□ -2.26
MSF1P08425 RPL16AYIL133C 600 nt0.9□□□□□ -2.27
MSF1P08425 ISF1YMR081C 1017 nt0.9□□□□□ -2.27
MSF1P08425 RUF22RUF22 515 nt0.9□□□□□ -2.27
MSF1P08425 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.9□□□□□ -2.27
MSF1P08425 YCK3YER123W 1575 nt0.9□□□□□ -2.27
MSF1P08425 DOP1YDR141C 5097 nt0.89□□□□□ -2.27
MSF1P08425 RIM20YOR275C 1986 nt0.89□□□□□ -2.27
MSF1P08425 SNU56YDR240C 1479 nt0.89□□□□□ -2.27
MSF1P08425 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.89□□□□□ -2.27
MSF1P08425 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.89□□□□□ -2.27
MSF1P08425 AIM9YER080W 1884 nt0.88□□□□□ -2.27
MSF1P08425 CYC7YEL039C 342 nt0.88□□□□□ -2.27
MSF1P08425 YGR025WYGR025W 303 nt0.88□□□□□ -2.27
MSF1P08425 YKL123WYKL123W 381 nt0.88□□□□□ -2.27
MSF1P08425 SET3YKR029C 2256 nt0.88□□□□□ -2.27
MSF1P08425 SCC2YDR180W 4482 nt0.88□□□□□ -2.27
MSF1P08425 YLL032CYLL032C 2478 nt0.87□□□□□ -2.27
MSF1P08425 UPS1YLR193C 528 nt0.87□□□□□ -2.27
MSF1P08425 snR13snR13 124 nt0.87□□□□□ -2.27
MSF1P08425 SLY1YDR189W 2001 nt0.87□□□□□ -2.27
MSF1P08425 YDL206WYDL206W 2289 nt0.86□□□□□ -2.27
MSF1P08425 STO1YMR125W 2586 nt0.86□□□□□ -2.27
MSF1P08425 UBP3YER151C 2739 nt0.86□□□□□ -2.27
MSF1P08425 MMS4YBR098W 2076 nt0.86□□□□□ -2.27
MSF1P08425 MXR1YER042W 555 nt0.86□□□□□ -2.27
MSF1P08425 HUR1YGL168W 333 nt0.86□□□□□ -2.27
MSF1P08425 RPL32YBL092W 393 nt0.86□□□□□ -2.27
MSF1P08425 RCN2YOR220W 798 nt0.86□□□□□ -2.27
MSF1P08425 TSC3YBR058C-A 243 nt0.86□□□□□ -2.27
MSF1P08425 RFX1YLR176C 2436 nt0.86□□□□□ -2.27
MSF1P08425 YDR029WYDR029W 315 nt0.85□□□□□ -2.27
MSF1P08425 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.85□□□□□ -2.27
MSF1P08425 YGL239CYGL239C 315 nt0.85□□□□□ -2.27
MSF1P08425 PRP16YKR086W 3216 nt0.85□□□□□ -2.27
MSF1P08425 SMC1YFL008W 3678 nt0.84□□□□□ -2.27
MSF1P08425 LCD1YDR499W 2244 nt0.84□□□□□ -2.27
MSF1P08425 PDE2YOR360C 1581 nt0.84□□□□□ -2.27
MSF1P08425 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.84□□□□□ -2.27
MSF1P08425 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.84□□□□□ -2.27
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