Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms