Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASS1P00966 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASS1P00966 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASS1P00966 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASS1P00966 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASS1P00966 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASS1P00966 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASS1P00966 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASS1P00966 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASS1P00966 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASS1P00966 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASS1P00966 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASS1P00966 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASS1P00966 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASS1P00966 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASS1P00966 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASS1P00966 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASS1P00966 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASS1P00966 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASS1P00966 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASS1P00966 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASS1P00966 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASS1P00966 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASS1P00966 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASS1P00966 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASS1P00966 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASS1P00966 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASS1P00966 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASS1P00966 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASS1P00966 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASS1P00966 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASS1P00966 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ASS1P00966 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASS1P00966 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASS1P00966 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASS1P00966 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ASS1P00966 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ASS1P00966 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ASS1P00966 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ASS1P00966 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ASS1P00966 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ASS1P00966 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASS1P00966 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms