Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED1O96006 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED1O96006 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED1O96006 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED1O96006 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED1O96006 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED1O96006 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED1O96006 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED1O96006 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED1O96006 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED1O96006 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED1O96006 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED1O96006 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED1O96006 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED1O96006 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED1O96006 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED1O96006 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED1O96006 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED1O96006 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED1O96006 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED1O96006 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED1O96006 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED1O96006 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED1O96006 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED1O96006 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED1O96006 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED1O96006 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED1O96006 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED1O96006 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED1O96006 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZBED1O96006 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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