Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSCO60682 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSCO60682 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSCO60682 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSCO60682 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSCO60682 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSCO60682 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSCO60682 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSCO60682 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSCO60682 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSCO60682 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSCO60682 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSCO60682 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSCO60682 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSCO60682 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSCO60682 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSCO60682 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSCO60682 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSCO60682 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MSCO60682 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSCO60682 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSCO60682 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSCO60682 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSCO60682 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSCO60682 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MSCO60682 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSCO60682 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSCO60682 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSCO60682 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSCO60682 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSCO60682 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSCO60682 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSCO60682 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSCO60682 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MSCO60682 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSCO60682 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSCO60682 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSCO60682 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSCO60682 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSCO60682 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSCO60682 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
MSCO60682 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSCO60682 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSCO60682 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSCO60682 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MSCO60682 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSCO60682 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSCO60682 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSCO60682 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSCO60682 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSCO60682 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSCO60682 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms