Protein–RNA interactions for Protein: O60645

EXOC3, Exocyst complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOC3O60645 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOC3O60645 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXOC3O60645 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms